سیستم DYCP-31DN یک سیستم الکتروفورز افقی است. در الکتروفورز ژل افقی، ژل در جهت افقی ریختهگری میشود و در بافر در حال اجرا در جعبه ژل فرو میرود.جعبه ژل به دو قسمت تقسیم می شود که ژل آگارز این دو را از هم جدا می کند.همانطور که قبلاً گفته شد، یک آند در یک سر قرار دارد، در حالی که یک کاتد در انتهای دیگر قرار دارد.بافر در حال اجرا یونی اجازه می دهد تا در هنگام اعمال جریان، یک گرادیان شارژ ایجاد شود.علاوه بر این، بافر برای خنک کردن ژل عمل می کند که با اعمال شارژ گرم می شود.بافر در حال اجرا اغلب برای جلوگیری از تشکیل گرادیان pH به گردش در می آید.ما اندازه های متفاوتی از شانه ها برای استفاده داریم. شانه های مختلف این سیستم الکتروفورز افقی را برای هر کاربرد ژل آگارز از جمله الکتروفورز زیردریایی، برای الکتروفورز سریع با نمونه های کم، DNA، الکتروفورز زیردریایی، برای شناسایی، جداسازی و آماده سازی DNA، و برای اندازه گیری وزن مولکولی
در طول الکتروفورز، یک ژل در سینی ریخته گری تشکیل می شود.سینی حاوی "چاهک" های کوچکی است که ذرات مورد نظر برای آزمایش را در خود نگه می دارد.چندین میکرولیتر (µL) از محلول حاوی ذراتی که میخواهید آزمایش کنید، به دقت در چاهها بارگذاری میشوند.سپس یک بافر که جریان الکتریکی را هدایت می کند، در محفظه الکتروفورز ریخته می شود.سپس سینی ریخته گری حاوی ذرات به دقت داخل محفظه قرار می گیرد و در بافر غوطه ور می شود.در نهایت محفظه بسته شده و منبع تغذیه روشن می شود.آند و کاتد که توسط جریان الکتریکی ایجاد می شوند، ذرات باردار مخالف را جذب می کنند.ذرات به آرامی در ژل به سمت بار مخالف حرکت می کنند.برق قطع می شود و ژل خارج می شود و بررسی می شود.