سیستم DYCP-31DN یک سیستم الکتروفورز افقی است. در الکتروفورز ژل افقی، یک ژل در جهت افقی ریختهگری میشود و در بافر در حال اجرا در جعبه ژل فرو میرود. جعبه ژل به دو قسمت تقسیم می شود که ژل آگارز این دو را از هم جدا می کند. همانطور که قبلاً گفته شد، یک آند در یک سر قرار دارد، در حالی که یک کاتد در انتهای دیگر قرار دارد. بافر در حال اجرا یونی اجازه می دهد تا در هنگام اعمال جریان، یک گرادیان شارژ ایجاد شود. علاوه بر این، بافر برای خنک کردن ژل عمل می کند که با اعمال شارژ گرم می شود. بافر در حال اجرا اغلب برای جلوگیری از تشکیل گرادیان pH به گردش در می آید. ما اندازههای متفاوتی از شانهها برای استفاده داریم. شانههای مختلف این سیستم الکتروفورز افقی را برای هر کاربرد ژل آگارز از جمله الکتروفورز زیردریایی، برای الکتروفورز سریع با نمونههای کم، DNA، الکتروفورز زیردریایی، برای شناسایی، جداسازی و آمادهسازی DNA، و برای اندازه گیری وزن مولکولی
در طول الکتروفورز، یک ژل در سینی ریخته گری تشکیل می شود. سینی حاوی "چاهههای" کوچکی است که ذرات مورد نظر را در خود نگه میدارد. چندین میکرولیتر (µL) از محلول حاوی ذراتی که میخواهید آزمایش کنید به دقت در چاهها قرار میگیرد. سپس یک بافر که جریان الکتریکی را هدایت می کند به محفظه الکتروفورز ریخته می شود. سپس سینی ریخته گری حاوی ذرات به دقت در محفظه قرار می گیرد و در بافر غوطه ور می شود. در نهایت محفظه بسته می شود و منبع برق روشن می شود. آند و کاتد که توسط جریان الکتریکی ایجاد می شوند، ذرات باردار مخالف را جذب می کنند. ذرات به آرامی در ژل به سمت بار مخالف حرکت می کنند. برق قطع می شود و ژل خارج می شود و بررسی می شود.